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    河南新乡:新乡市第一人民医院成功创建新乡市呼吸道感染性疾病诊疗重点实验室

    时间:2023-10-19   来源:人民医药网

    人民医药网河南讯(周宾祖 通讯员 曹臣龙)自2003年“非典”以来,流行性病毒频发,2009年禽流感病毒爆发、埃博拉病毒、寨卡病毒、甲流等。最令大家触目惊心的是2019年全球大流行的新冠病毒,流行性病毒已经对人民群众的生命财产安全构成严重威胁!

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    面对突如其来的流行疫情,新乡市第一人民医院和新乡市其他兄弟单位顽强抗击,写下无数感人篇章。细数,屡次疫情来临,呼吸科均首当其冲,俨然成为捍卫人民群众生命的桥头堡!为化被动为主动,在医院领导的指导和支持下决定依托《感染性疾病科/呼吸与危重症医学三病区》成立《新乡市呼吸道感染性疾病诊疗重点实验室》,以下简称“实验室”。

    实验室以呼吸疾病应用基础研究为重点,以转化医学为发展战略,以提高呼吸系统疾病防治为目标,努力提升呼吸疾病基础研究和临床诊治水平。

    为更好服务临床,提高科研转化。实验室引进目前业内先进的mNGS、tNGS等二代测序技术。

    临床上,传统的病原鉴定主要以培养和生化检测为基础,但随着下一代测序技术的不断进步,宏基因组测序(mNGS)提高了病原检测的效率,并有助于识别难以培养的病原微生物;测序识别抗生素抗性微生物也为改善治疗方案提供了依据。

    宏基因检查(mNGS)全称病原微生物宏基因组测序,是一种二代核酸测序技术,通过检测标本中所有病原体包括细菌、真菌、病毒等微生物的DNA,RNA等遗传物质,进行高通量测序,基于生物信息学算法,与临床病原数据库进行比对分析,鉴定样本中病原微生物种类及功能信息,来判断是何种病原体感染导致疾病的产生。是一种新型的基因水平的检测技术,无需预设、无需培养、无偏好性,为临床抗感染提供精准的病原学证据。

    与传统方法相比,mNGS展现了强大的病原体检测能力。对罕见病原体,如血液样本中的汉坦病毒;新发病原体,如脑脊液样本中的伪狂犬病病毒;混合感染,如脑脊液样本中的球孢枝孢与乙型脑炎病毒;难以检测病原体,如肺泡灌洗液样本中的耶氏肺孢子菌;耐药检测,如组织样本中的金黄色葡萄球菌及其耐药基因tet(K)等表现出更好的病原检测能力。此外mNGS还可用来排除感染,如检测结果阴性则可排除病原微生物引起的感染性疾病。

    简单的说,传统的检测手段就像是在鱼塘里钓鱼,通过调整鱼饵,让一种或多种鱼上钩。宏基因组检测则对所有病原微生物一网打尽,就像是直接把放干鱼堂的水,把所有的鱼以及虾米、乌龟等其他生物全部捞出来。一个接一个的挑选,直到找到你想要的。

    可以说宏基因组检测是目前针对病原感染最全面的检测手段。mNGS检测范围广泛,可适用于①呼吸系统感染:肺泡灌洗液、气道抽吸物、鼻咽拭子、诱导痰、深部痰、肺部组织等②中枢神经系统感染:脑脊液、脑引流液等样本。③血流感染等:血液样本等。④其他感染类型:病灶部位组织标本、胸水、腹水、脓液、尿液和关节液等其他体液。

    病原靶向测序(tNGS)通过超多重PCR扩增与高通量测序两种技术的结合,能够对待测样本中几十至上百种已知病原微生物及其毒力和/或耐药基因进行检测。对低浓度的病原微生物的检测,特别是其毒力和/或耐药基因检测,与病原宏基因组测序(mNGS)相比,tNGS具有病原谱范围明确、检测精度高、测序成本低等优势。

    因此tNGS在临床检验领域正受到越来越多的关注,正被广泛应用于呼吸道感染、血流感染、中枢神经系统感染等临床检验领域。

    实验设备

    实验室建成后,将有效提升新乡市、医院在感染性疾病诊疗方面的水平,为临床“重拳猛击”“降阶梯治疗”提供依据,更能够提高呼吸感染领域精准诊疗的能力!

     特殊时期,诊疗规范至关重要。“发热”患者经发热门诊入院,可在实验室完成常规 生化 病毒联检 TSPOT 核酸检测等急诊检查。特殊患者可在30分钟内给出检测结果,一方面可及时给临床诊断依据,另外可以保护院内大实验室被污染的可能性,保障更多患者的利益。

    因此,实验室运行后,可实现模块化管理模式,患者享受一站式服务。

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    实验室目前是新乡市唯一一个以呼吸感染性疾病为重点研究方向的部门,未来也将不断承担科研任务应对各种突发状况,积极引进、吸取国内外先进技术服务临床。另外,实验室更方便数据采集和整理,总结研究,形成科研成果并形成转化,为新乡市的疾病防治工作贡献力量。

    (责编:余棠)

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